MAS je nejnižším článkem implementační struktury politik místního rozvoje jako partner centrálně působících řídících orgánů jednotlivých sektorově nastavených programů.
Existuje přímá návaznost Programového rámce IROP, OPZ a PRV a příslušného Programového dokumentu. Ta spočívá především v provázání cílů a monitorovacích indikátorů. Programové rámce jednotlivých MAS se tedy přímo zavazují k naplňování monitorovacích indikátorů fondů, ze kterých jsou financovány.
Na MAS je nahlíženo i jako na tzv. zprostředkující subjekt, který jménem Řídícího orgánu na základě Dohody o delegování činností a pravomocí provádí některé činnosti, jako vyhlašování výzev, hodnocení, výběr a eventuálně i schvalování projektů, monitorování, provádění plateb, kontrolu a hodnocení projektů.
Zároveň je také bezprostředním partnerem žadatelů a příjemců podpory, kterým poskytnou základní informace a podporu v období přípravy, výběru (schválení) a realizace jejich projektů. MAS je hlavním kontaktním místem pro konečné příjemce. Komunikace mezi konečnými příjemci a platebními agenturami, resp. řídícími orgány, se tak u těchto projektů může omezit na minimum. Veškerý styk platební agentury s příjemci zajišťuje MAS, která platební agentuře předává k supervizi a k archivaci již zpracovanou, utříděnou a zkontrolovanou dokumentaci vč. závěrečných monitorovacích zpráv a zápisů z kontrol projektů.
